Después de su comparecencia en el Juzgado 8º de Instrucción, el exfiscal Luis Martínez fue trasladado al penal de Metapán donde guardara prisión hasta que sea juzgado por el delito de Omisión de Investigación y Fraude Procesal.
Durante su período como fiscal general, Martínez envió a prisión a una gran cantidad de delincuentes, sin embargo confía en el sistema de Centros Penales para que mantengan su integridad física mientras se resuelve su caso.
«Es responsabilidad de Centros Penales mantener mi integridad física en el penal. He metido a mucha gente en la cárcel», declaró y agregó que «No temo por la gente que metí a la cárcel. No temo, por eso me entregué. Tengo dignidad, esto es una persecución política».