En la Prueba de Aprendizaje y Aptitudes para Egresados de Educación Media (PAES) muestra un incremento positivo en la mayoría de materias que históricamente han tenido un promedio bajo; sin embargo, esto no abonó a que la media nacional sufriera el mismo efecto, pues pasó de 5.30 en 2015 a 5.24 en 2016.
La nota promedio de matemáticas fue de 4.85, en 2015 de 4.44; en ciencias naturales de 5.45, en 2015 de 5.38; en lenguaje y literatura de 5.61, en 2015 de 5.41; y en sociales se experimentó una baja, pues el promedio de este año fue de 5.83, el del 2015 de 6.17.
Un dato a resaltar en los resultados es que las notas obtenidas en matemáticas, ciencias y lenguaje han sido las mejores en los últimos seis años.
La institución privada con la mejor calificación fue el Colegio Champagnat con 8.73, seguido del Colegio Español Padre Arrupe con 8.65, el Colegio Centroamérica con 8.61 y el Instituto Católico de Oriente en San Miguel con 8.55.
En el sector público, fueron el Instituto Nacional de Uluazapa en San Miguel con 8.22, el Complejo Educativo General Manuel José Arce de Morazán con 8.21, el Instituto Nacional Licda. Cándida Asunción Reyes de La Unión con 8.09 y el el Instituto Nacional El Sauce de La Unión con 8.0.
De esta manera, la nota en el sector público fue de 5.22, mientras en el privado 5.99. la prueba se realizó a un total de 79,525 estudiantes en 312 sedes distribuidas en los 14 departamentos del país.