Los dos gobierno del FMLN han modificado a su antojo, durante varias ocasiones, el logo de el Gobierno de El Salvador, y ahora se molestan porque el Presidente Electo ha agregado 14 estrellas alrededor del Escudo Nacional en su invitación al cuerpo diplomático y comunidad internacional acreditados en el país a una cena en la que informará sobre los preparativos de la toma de posesión.
En la presidencia de Mauricio Funes el logo fue cambiado a: «EL SALVADOR, un gobierno con sentido humano», con una bandera en forma de «S» horizontal; luego se cambió a: GOBIERNO DE EL SALVADOR, UNIR, CRECER, INCLUIR; y finalmente lo dejó como: «GOBIERNO DE EL SALVADOR», solo con la figura del Escudo Nacional.
A la llegada de Salvador Sánchez Cerén a la presidencia, fue modificado nuevamente por: «GOBIERNO DE EL SALVADOR, UNÁMONOS PARA CRECER», esta vez con la simulación de la bandera en la parte de abajo; y más recientemente lo han dejado como: «GOBIERNO DE EL SALVADOR», con el Escudo Nacional, más la frase: «NUESTRO LEGADO, PRESIDENTE SALVADOR SÁNCHEZ CERÉN 2014-2019.
