El FMLN realizó declaraciones luego de la aprobación de la Ley de Reconciliación Nacional, alegando que estaban en contra de dicha ley; sin embargo, tampoco votaron en contra, solo abstuvieron su voto para «evitar» su aprobación.
El Secretario Jurídico de la Presidencia, Conan Castro, mencionó que «el hecho que el FMLN no votara no significa que está en contra de la legislación», abonando a la crítica sobre esta ley que da impunidad a los asesinos y torturadores durante el conflicto armado.
El FMLN que durante años hizo creer al pueblo que luchaban junto a ellos, desamparó a quienes entregaron su vida por El Salvador, permitiendo que se olvide lo que según las leyes internacionales no puede ser olvidado, en concreto, los delitos de lesa humanidad.